¿Es posible que no se me descuente el aporte de salud por la pensión pagada por FOPEP, debido a que tengo otra pensión que es pagada por una entidad diferente?

No es posible, puesto que el descuento por concepto de salud que realiza el Consorcio FOPEP es de carácter obligatorio y se efectúa de acuerdo con lo establecido en el Decreto 780 de 2016, en su Artículo 2.2.1.1.2.1 que prescribe:

Artículo 2.2.1.1.2.1. Base de cotización de los trabajadores con vinculación contractual, legal y reglamentaria y los pensionados.

(…) Parágrafo. Cuando el afiliado perciba salario o pensión de dos o más empleadores u ostente simultáneamente la calidad de asalariado e independiente, las cotizaciones correspondientes serán efectuadas en forma proporcional al salario, ingreso o pensión devengado de cada uno de ellos (…)”.